В те судьбоносные дни Второй мировой войны, когда кровь и пот текли рекой, камикадзе Коити Сикисима решился на отчаянный поступок - посадить свой самолет на острове Одо, где возвышалась ремонтная база императорской армии Японии. Но, как назло, именно в этот вечер на них напал чудовищный ящер, Годзилла, здесь же местные жители называли его так.
После трагических событий, коити возвращается в разрушенный бомбами Токио - его родители погибли, а от родного дома остались лишь обломки памяти. Однако на его пути встречается девушка, потерявшая семью, и младенец, которого она спасла во время адского воздушного налета. Вместе им предстоит искать своё место в этом мире, в котором кровавые следы войны еще не успели стереться.
Время неумолимо идет, жизнь начинает налаживаться, а Коити присоединяется к команде по обезвреживанию мин в Токийском заливе. И вот однажды их хлипкий катер сталкивается с Годзиллой, ужасным чудовищем, ставшем еще больше и свирепее после ядерных испытаний на атолле Бикини. Вступает новая глава в их судьбах, полная опасностей и испытаний, но они готовы противостоять всему, чтобы защитить свою родину и своих близких.